déjà il faut utiliser la classe XslTransform avec sa méthode Load pour charger ton XSLT puis la méthode Transform pour effectuer la transformation...
pour ce qui est du XSLT proprement dit, tu pourras utiliser la méthode document() :
<xsl:transform version="1.0"
xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform">
<xsl:template match="/">
<Container>
<xsl:copy-of select="document('fichier1.xml')"/>
<xsl:copy-of select="document('fichier2.xml')"/>
</Container>
</xsl:template>
</xsl:stylesheet>